Necílené sekvenování městských odpadních vod dokáže odhalit celou řadu virů (i dosud neznámých), a poskytnout tak včasné varování před pandemiemi. Jeho užitečnost ale závisí na citlivosti (P2RA): jak silný je signál viru v odpadní vodě při dané úrovni prevalence? Během programu Frontier Biodefense Fellowship v Pivotal Research jsem pod vedením Lennarta Justena (MIT, Broad Institute) zpřesnil odhady P2RA organizace SecureBio pro respirační viry, a to pomocí více dat z nosních výtěrů a aktualizovaného bayesovského modelu, v němž se prevalence virů může měnit týden od týdne. U sedmi nejčastěji zachycených virů se rozpětí věrohodných hodnot P2RA zúžilo dvakrát až pětkrát. Na projektu budu dále pracovat v rámci dvouměsíčního prodloužení.
Níže je poster v angličtině (kliknutím otevřete PDF verzi):
